理研セミナー

高度好熱菌 丸ごと一匹 プロジェクト
第8回 連携研究会

2009年8月21日(金) ~ 8月23日(日)



はじめに


0.X線イメージング手法の最近の話題

石川哲也
((独)理化学研究所播磨研究所・放射光科学総合研究センター)


1~8.Thermus thermophilusHB8のシステム生物学へ向けて

理研 放射光科学総合研究センター 放射光システム生物学研究グループ


7.放射光科学総合研究センターにおけるタンパク質X線結晶構造解析実験データの公開

淺田 征彦1, 水谷 尚志1,菅原 道泰1, 新海 暁男1, 倉光 成紀1, 国島 直樹1
1 理研播磨・放射光科学総合研究センター,1 SPring8 Center)


8.理研バイオリソースセンター遺伝子材料開発室におけるThermus thermophilus HB8 リソースの整備

村田武英,久次米夕佳里,栗原千登勢,益﨑智子,小幡裕一
(理研バイオリソースセンター遺伝子材料開発室)


9.好熱菌ゲノムデータベースの作成

小山芳典
(産総研 生物機能工学)


10.コヒーレントX線回折を用いたヒト染色体の三次元可視化

西野吉則1,高橋幸生2,今本尚子3,石川哲也1,前島一博4
1理研放射光科学総合研究センター,2大阪大学,3理研基幹研,4遺伝研)


11.走査型X線顕微鏡を用いた細胞イメージング

松山智至1,志村まり2,藤井正輝1,脇岡敏之1,三村秀和1,佐野泰久1,矢橋牧名3,西野吉則3,玉作賢治3,石川哲也3,山内和人1
1大阪大学,2国立国際医療センター,3理化学研究所)


12.低温電顕微鏡法よる生体超分子構造の解析

米倉功治,眞木さおり
(理研播磨)


13.SPring-8 でのタンパク質微小結晶構造解析の現状と将来

山本雅貴1,平田邦生1,上野剛1,清水伸隆1,2,熊坂崇1,2
1 理研SPring-8 センター,2 JASRI/SPring-8)


14.SPring-8 構造生物ビームラインにおける高速高精度回折データ測定方法の開発とリモートデータ測定システムの開発

長谷川和也1,平田邦生2,清水伸隆1,2,馬場清喜1,引間孝明2,古川行人1,上野剛2,前田大輔2,熊坂崇1,2,山本雅貴1,2
1SPring-8/JASRI,2 理研 放射光科学総合研究センター)


15.中性子構造解析の現状と展望

栗原和男,玉田太郎,大原高志,黒木良太
(日本原子力研究開発機構)


16.好熱菌由来ADP リボースピロリン酸分解酵素の中性子結晶構造解析

玉田太郎1,安達基泰1,栗原和男1,大賀拓史2,倉光成紀 2,黒木良太1
1 日本原子力研究開発機構, 2大阪大学)


17.トレハロース合成に関わる高度好熱菌由来グリコシルトランスフェラーゼの立体構造解析

岡崎伸生1,玉田太郎1, 加藤優2, 三浦裕2, 黒木良太1
1原子力機構,2キリンホールディングス(株))


18.中度好塩菌由来ヌクレオシド・二リン酸キナーゼ(HaNDK)の多量体構造

新井栄揮1,米澤悌1,岡崎伸生1,玉田太郎1,徳永廣子2,石橋松二郎2,徳永正雄2,黒木良太1
1 原子力機構,2 鹿児島大学)


19.大腸菌を用いた網羅的機能ネットワーク解明に向けて

森 浩禎
(奈良先端科学技術大学院大学・バイオサイエンス研究科)


20.機能未知タンパク質の機能を計算機でどうやって明らかにしていくか

由良 敬1,2
1 お茶の水女子大学大学院人間文化創成科学研究科,2 お茶の水女子大学生命情報学教育研究センター)


21.機能未知タンパク質の機能発見に向けて:高度好熱菌Thermus thermophilus HB8における転写制御メカニズムの研究

新海暁男
(理研 播磨研 放射光科学総合研究センター)


22.ファージ感染におけるThermus thermophilus CRISPR システムの発現プロファイル解析

上利佳弘、坂本恵子、新海暁男
(理研 播磨研 放射光科学総合研究センター)


23.高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来TetRファミリー転写因子TTHA0101 (FadR) の構造と機能

坂本恵子,上利佳弘,上利和子,尾崎愛美,新海暁男
(理研 播磨研 放射光科学総合研究センター)


24.Cold shock protein の転写産物調節システムに関わる機能の解析

妻鹿良亮1,新海暁男2,中川紀子2,3,増井良治2,3,倉光成紀1,2,3
1 阪大・院生命機能, 2 理研・播磨研, 3 阪大・院理・生物科学)


25.機能未知タンパク質の機能発見に向けて:Omics 解析を併用した新しい酵素機能の発見

増井良治1,2,大賀拓史1,3
1阪大院理・生物, 2理研・播磨研, 3ヒューマン・メタボローム・ テクノロジーズ(株))


26.生物間で共通する機能未知必須遺伝子gcpのThermusを用いた遺伝学的解析~DNA修復機構との関連を中心に~

北原一正,星野貴行,中村顕
(筑波大学大学院生命環境科学研究科)


27.Thermus thermophilus HB8 タンパク質の機能発見研究:タンデム型 Universal Stress Protein (TTHA0350) の構造解析

飯野 均1,3,海老原彰郎1,後藤 勝2,広津 建1,倉光成紀1,3
1理研・播磨研,2東邦大・理,3阪大・院理)


28.生物間で高度に保存されている機能未知タンパク質TTHA1606の構造機能解析

友池史明1,若松泰介2,中川紀子2,3,増井良治2,3,倉光成紀1,2,3
1阪大・院生命機能,2阪大・院理・生物科学,3理研・播磨/SPring-8)


29.Thermus thermophilus HB8の DNA ミスマッチ修復システム: MutL エンドヌクレアーゼの機能解析

福井健二1,飯野均1,2,満足美穂1,Kwang Kim3, 高畑良雄3, 井上由美子1,中川紀子1,3,増井良治1,3,倉光成紀1,2,3
1理研・播磨研,2阪大・院生命機能,3阪大・院理)


30.Thermus thermophilus HB8のDNA 相同組換え系

井上 仁1,伊藤 隆2,柴田 武彦1,美川 務1,3
1 理研基幹研,2 首都大学,3 理研放射光科学総合研)


31.Identification of the SSB binding site on RecO by NMR analysis

Jin Inoue1, Yutaka Ito2, Takehiko Shibata1,3 and Tsutomu Mikawa1,3,4
1RIKEN Advanced Science Institute, 2Department of Chemistry, Tokyo Metropolitan University, 3International Graduate School of Arts and Science, Yokohama City University, 4RIKEN SPring-8 center )


32.高度好熱菌のタンパク質合成システム

別所義隆1,2、横山茂之1,3
1理研・横浜研・生命分子、2理研・播磨研、3東大・院理)


33.Thermus thermophilus のtRNA修飾酵素遺伝子破壊株の解析-tRNA m7G46 メチル化酵素はネットワークの鍵酵素の一つである-

冨川 千恵1、横川 隆志2、金井 保3、堀 弘幸1,4,5
1 愛媛大・院理工、2 岐阜大・工、3京都大・院工、4 愛媛大・ベンチャービジネスラボラトリー、5理研・播磨・SPring-8)


34.FAD/Folate 依存 tRNA m5U54 メチル化酵素 TrmFO の基質認識メカニズム解明に向けて

山下 光輝1,西増 弘志2,岩下 知香子1,石谷 隆一郎2,平田 章1,濡木 理2,堀 弘幸1,3
1 愛媛大・院理工 物質生命工学,2東京大・医科研・基礎医科学,3 愛媛大・VBL)


35.Thermus thermophilus 由来 dihydrouridine 合成酵素 (Dus) の機能解析

吉田 剛士1,岩崎 絵梨1,粟井 貴子1,冨川 千恵1,平田 章1,2,堀 弘幸1,2
1 愛媛大・院理工 物質生命工学,2愛媛大・VBL)


36.高度好熱菌Thermus thermophilusの線毛に関する研究

玉腰雅忠,尾方美沙樹,奥田桃子,常泉賢司、山岸明彦
(東薬大 生命科学)


37.プリン・ピリミジンヌクレオチド生合成系の丸ごと解析

河合剛太1,2,鈴木咲子1,三井翔平3,金川真由美2,馬場清喜2,4,中川紀子2,5,海老原章郎2,三瓶嚴一2,3
1千葉工大・工,2理研・播磨研,3電通大・量子物質工,4高輝度光科学研究センター,5阪大・院理)


38.Thermus thermophilus 由来 PurL の結晶構造解析

鈴木咲子1,矢内久陽2,金川真由美2,田村さと子1,渡邊雄三1,布施亨太郎1,馬場清喜2,三瓶嚴一2,3,河合剛太1,2
1 千葉工大・工,2 理研・播磨研,3 電通大・量子物質工)


39.Geobacillus kaustphillus 由来PurH の結晶構造解析

三井翔平1,金川真由美2,馬場清喜2,3,中川紀子2,4,海老原章郎2,河合剛太2,5,三瓶嚴一1,2
1 電通大・量子物質工, 2 理研・播磨研, 3 高輝度光科学研究センター,4阪大・院理,5千葉工大・工)


40.シチジン特異的なヌクレオシドキナーゼの基質認識機構の解明

友池史明1,中川紀子2,3,増井良治2,3,倉光成紀1,2,3
1阪大・院生命機能,2阪大・院理・生物科学,3理研・播磨/SPring-8)


41.高度好熱菌由来の機能未知タンパク質TTHA1091の機能解析

常藤明子1,友池史明2,中川紀子1,3,増井良治1,3,倉光成紀1,2,3
1阪大・院理,2阪大・院生命機能,3理研・播磨研)


42.Thermus thermophilus HB8のTthA0610, TthA1422発現系の構築と機能解析 〜ペリプラズム酵素群のシステムバイオロジーに向けて〜

田村 隆1,吉田 隆真1,海老原 章朗3,倉光 成紀2,稲垣 賢二1
1岡山大学大学院 自然科学研究科 バイオサイエンス専攻部, 2大阪大学大学院 理学研究科 生物学専攻, 3岐阜大学 応用生物科学部)


43.銅イオン輸送性P-type ATPase の機能解析と新規相互作用因子の同定

桑原直之,小田隆, 橋本博, 佐藤衛, 清水敏之
(横浜市大院・生命ナノ)


44.Thermus thermophilusHB27由来α-アミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)の基質認識機構の解析

大内拓也1,富田武郎1,宮川智治1,葛山智久1,西山真1,2
1東京大学 生物生産工学研究センター,2理研SPring-8)


45.高度好熱菌Thermus themophilus由来グルタミン酸脱水素酵素における活性調節の分子機構の解析

富田武郎1,宮崎高志1,葛山智久1,西山真1,2
1東大・生物生産工学研究センター,2理研SPring-8)


46.高度好熱菌由来N-Acetyl-γ-glutamyl-phosphate reductaseの立体構造

後藤 勝1,宮原郁子2,広津 建3
1東邦大,2大阪市大・院理,3理研・播磨研)


47.高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来Threonine dehydratase変異体の作成

臼井 舞1,後藤 勝1,佐藤 浩之1,山内 貴恵2,三原 久明2,栗原 逹夫2,江崎 信芳2,宮原 郁子3,広津 建4
1東邦大・理,2京大・化研,3大阪市大・院理,4理研・播磨研)


48.高度好熱菌由来ホモセリン脱水素酵素の結晶構造解析

森 まり萌1,近江理恵1,2,広津 建1,2,神谷信夫1,2,宮原郁子1,2
1大市大・院理,2理研・播磨研)


49.Thermus thermophilus のDeoxyhypusine 合成酵素の生理機能は何か

竹田 悠見子,岩崎-林 容子,森屋 利幸,太田 敏博,大島 泰郎
(共和化工・環境微生物学研究所、東京薬科大学生命科学部)


50.好熱菌のシステム的理解に向けたたたき台

藤本仰一1
1大阪大学理学研究科)


51.枯草菌の一般ストレス応答機構に関する構造生物学的研究

星野武司,牧野正知,Teh Aik Hong,熊坂崇
(財団法人 高輝度光科学研究センター)


52.新規ヌクレオチド除去修復システムに関わるアルキル基転移酵素様タンパク質の機能解析

森田理日斗1,中川紀子1,2,倉光成紀1,2,増井良治1,2
1 阪大・院理・生物科学,2 理研・播磨研)


53.転写共役修復システムにおける転写共役修復因子の機能解析

菱沼 久紘1,森田 理日斗1,中川 紀子1,2,増井 良治1,2,倉光 成紀1,2
1 阪大・院理・生物科学,2 理研・播磨研)


54.生物界に広く保存されたヌクレアーゼEndoV の構造機能解析

井上真男1, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
1 阪大・院理・生物科学, 2 理研・播磨研)


55.高度好熱菌DNA塩基除去修復系サブシステム: endonuclease IV

淺野瑠一1,中川紀子1,2,増井良治1,2,倉光成紀1,2
1阪大・院理・生物科学,2理研・播磨研)


56.RecJ 型エキソヌクレアーゼの構造機能解析

若松泰介1, 北村吉章2, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
1 阪大・院理・生物科学,2理研・播磨研)


57.高度好熱菌由来RecJの機能解析

小寺 祐太郎1, 若松 泰介1, 中川 紀子1,2, 増井 良治1,2, 倉光 成紀1,2
1 阪大・院理・生物科学,2理研・播磨研)


58.T. thermophilus HB8 由来 3’-5’ exonuclease TTHB178 の分子機能解析

島田敦広1,中川紀子1,2,増井良治1,2,倉光成紀1,2
1 阪大・院理・生物科学,2理研・播磨研)


59.塩基除去修復系における DNA polymerase I の機能解析

間島恭子1,中川紀子1,2,増井良治1,2,倉光成紀1,2
1 阪大・院理・生物科学,2理研・播磨研)


60.Thermus thermophilus HB8 由来 DNA ポリメラーゼ X の機能ドメイン解析

中根修平1, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
1阪大院理・生物, 2理研・播磨研)


61.高度好熱菌由来ヌクレオイド構成タンパク質HU の機能解析

西田優也1, 中川紀子2,3, 増井良治2,3, 倉光成紀1,2,3
1 阪大•院生命機能, 2 理研•播磨研, 3 阪大•院理•生物科学)


62.Thermus thermophilus HB8 を用いた生物界に普遍的な新規RNA 分解システムの探求

石川大仁1, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
1 阪大院理・生物科学, 2 理研・播磨研)


63.新奇なRNase, TTHA1140 の関与する RNA 分解系サブシステムの解明

大山礼雅1, 石川大仁1, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
1阪大院理・生物科学, 2理研・播磨研)


64.Thermus thermophilus HB8 における Ser/Thr/Tyr リン酸化タンパク質の網羅的解析

高畑 良雄1, 金 光2, 中川 紀子2,3, 増井 良治2,3, 倉光 成紀1,2,3
1 阪大・院生命機能, 2 阪大・院理, 3 理研・播磨研)


65.高度好熱菌由来 cold shock protein 1 の転写および翻訳システムにおける機能解析

宮崎敏子1,妻鹿良亮2,Kwang Kim1,新海暁男3,満足美穂3,中川紀子1,3,増井良治1,3,倉光成紀1,2,3
1阪大・院理・生物科学,2阪大・院生命機能,3理研・播磨研)